農村三格化糞池由相聯的三個池子組成，中間由過糞管聯通，主要是利用厭氧發酵、中層過糞和寄生蟲卵比重大于一般混合液比重而易于沉淀的原理，糞便在池內經過30天以上的發酵分解，中層糞液依次由1池流至3池，以達到沉淀或殺滅糞便中寄生蟲卵和腸道致病菌的目的，第3池糞液成為優質化肥。
農村三格化糞池處理設施，一般是與水沖式廁所相配套，由進糞管、分格池、連通管、蓋板等部分組成。
一、設計原理
農村三格化糞池的結構設計應遵循的原則：
(1)第一池中應盡量保持足夠高的有機物濃度;應有利于通過厭氧發酵自下而上形成“沉渣--糞液--浮渣”三層結構;應使糞便在池中能保持不小于1米的深度;
(2)進糞管的設計上應盡量減少水力學的沖擊作用，以降低池底已沉淀的沉渣及寄生蟲卵不致劇烈泛起，不致使已形成的表層浮渣被不斷沖散。
(3)連通管的設計上，應盡量減少或防止未經厭氧發酵的新鮮糞便直接進入二池;盡量減少池底沉渣及寄生蟲卵得以通過連通管流入二池;盡量使進糞管和連通管之間拉開距離;連通管的坡度越陡越好，蓮蓬彎宜首選。
(4)第二池的作用為繼續發酵池，在設計上應盡量避免或減少第一池新鮮糞便、浮渣、沉渣、寄生蟲卵得以經連通管進入第二池;但因發酵需依賴高濃度的有機物及微生物，故其容積應小于第一池。
第一池
因為農村三格化糞池是要每天接納新鮮糞便的，為了達到分解糞便中的有機物，殺滅病原體和去除寄生蟲卵的目的，首先要求在第一池中為厭氧微生物的繁殖創造條件，使糞便中固相有機污物在厭氧環境下發酵分解成糞液和沼氣。只要第一池建造得密封嚴密，使空氣難以漏進，這樣，原來空氣中殘存的一些氧氣很快被好氧微生物消耗掉，形成沒有氧氣存在的厭氧環境。在厭氧微生物及尿素酶作用下，含氮有機物所生成的游離氨能透過細胞膜和卵殼將致病菌和蟲卵細胞殺死。第一池糞便厭氧降解過程中，不斷出現糞塊松散，松散的糞塊因發酵形成氣泡而浮升液面，變成糞皮(浮渣)，糞皮能隔絕空氣造成良好的厭氧環境，而糞便中比重較大的物質，又因散失氣泡而下沉，變成糞渣(沉渣)，糞皮與糞渣之間常形成這種不穩定的上下梭動狀態，蟲卵因其比重大于糞液，則由糞塊中釋出并在糞液靜止或流動緩慢的條件下逐漸下沉，于是在上層糞皮和底層糞渣之間出現一層糞水。但這一過程需要有一定時間，雖然在進糞時就會有糞水從第一池流入第二池，但需要在設計時使糞水在第一池有個適當長的水力停留時間。
對第一池，還要盡可能將新鮮的糞塊，糞皮和糞渣全部截留在池內，進行發酵，避免漂流到第二池。為此，二池隔墻間的連通管安裝位置的高低，管子口徑的大小和形狀都有講究，使連通管既不會堵塞，又能截住糞渣，只讓糞水順暢地流過。一般常用連通管為蓮蓬彎或斜插管，口徑大小宜為內徑100毫米。連通管下端距池底高度應為33厘米左右。這是由于這一高度正處在糞皮和糞渣兩層之間的清液層中間，連通管的上端是糞水的流出口，為控制第一池糞液面的高低，一般距池底1米，距池頂200毫米。
另外，當進糞時，為了不使浮在糞液面上的糞皮沖散和沉在池底的糞渣和蟲卵泛起，并盡可能保持糞液的平靜，形成良好的厭氧和沉卵環境，一般要求進糞管設計成琵琶形狀，并緊靠池壁以減小水沖力，口徑大小宜為內徑150毫米，進糞管下端沉入糞液面下，其深度約為糞液面高度的1/2處為宜。若進糞管下端處在糞液上，進糞時便會沖散糞皮，從而使糞皮涌入連通管而漂流人第二池。若進糞管口徑不夠大，進糞時會出現氣涌現象而被堵住。同時為了盡量避免形成短路，在施工中應盡可能拉開進糞管和連通管之間的距離。
第二池
由于第一池的作用主要是發酵、沉卵、截留沉渣及浮渣，但其厭氧發酵無法達到充分殺滅病原菌和寄生蟲卵的要求，所以有必要設置第二池，以補充第一池的不足，使糞液經過第二池處理后，流出的糞水能達到糞便無害化的基本要求。為此，要在第二池創造一個更好的厭氧發酵和沉卵環境。
由于第二池不像第一池那樣受到進糞時的強烈擾動，而只是受到經連通管從第一池流過來的糞液輕微沖擊，只要第二池同樣建造得密封嚴密，便可使第二池有個較寧靜的厭氧環境。由第一池流人第二池的糞液，在相對寧靜的厭氧環境下能進一步發酵，蟲卵比第一池更快地沉入池底。同時，經第二池深度厭氧發酵后，游離氨濃度上升，殺菌能力提高;另外，為細菌提供隱蔽的糞皮和糞渣顯著減少，而糞液中的有機物含量仍舊很高，雜菌之間的拮抗作用仍舊存在，從而使有機代謝產物對病原菌及病毒能進一步發揮“殺滅作用”。故相比之下，第二池的滅菌效果和沉卵效果要稍高于第一池，按其生物學作用，第一池以發酵和沉卵為主，第二池以滅菌為主。
在設計上，應充分防止糞塊、糞皮和糞渣流人第二池，由于主要發酵量已在第一池內完成。因此在第二池內糞液的平均停留時間相對可以短一些，也就是說，池的容積可以稍小于第一池。但在具體設計時，要為水沖式戶廁在第一池內進行糞便發酵時，易能形成較厚的糞皮創造條件，同時又要為施工時便于作業，所以采取不縮小第一池容積，相應擴大第二池容積，不改變二池總的發酵停留時間的辦法來實現。
第三池
從第三池流出的糞水，其所含的殘渣和蟲卵都已很少，基本上已達到糞便無害化衛生標準。因此，第三池的設置，除了能進一步促進沉卵和滅菌作用外，其主要目的是貯存糞水用于施肥。第三池容積大小，基本由施肥次數和每次施肥量來決定。若第三池的糞水不作肥料，而直接出口進行淺土滲濾法凈化處理，則第三池的容積可以適當縮小。
農村三格化糞池外接凈化溝或凈化坑
農村三格化糞池第三池糞水的理想出路是用于農田施肥，但部分地區的農民以化肥代替糞肥因而糞水用量減少，為此必須要為多余糞水尋找合適的凈化處理途徑。
(一)凈化原理
糞水淺土凈化的道理，可簡單歸納為：
1、利用淺層土壤微生物多，透氣性好的特點，加快糞水中有機物的好氧分解;
2、糞水通過表層土壤毛細管滲透作用，擴大淺土凈化面積;
3、糞水通過土壤表層蒸發和植被的升騰作用，不斷使水份消失。
(二)凈化裝置
1、出水管--采用內徑為lOO毫米，C18(200號)混凝土預制管。
2、凈化溝--采用內徑200毫米瓦簡，在1000毫米長度內交叉均勻地鉆直徑lO毫米的孔20個，然后將每節瓦筒連接，埋入寬400毫米、深450毫米的土溝中，使管子略有坡度，溝壁鋪聚乙烯薄膜，瓦筒外置填卵石，上面覆土植被。
3、凈化坑--用直徑700毫米、深600毫米的土坑，坑壁鋪聚乙烯薄膜，內填卵石，上面覆土植被。
(三)注意事項
1)凈化裝置宜設在具有滲透性及較強毛細管作用土壤，以設在菜地、草坪為佳，表面不能用水泥覆蓋;不應設在低洼地，若地勢太低，可以培土填高。
2)凈化裝置應距離水井30米以上。
3)如三格化糞池糞水的出水量多，宜采用凈化溝，出水量少，可用凈化坑。
三格化糞池施工
(一)選址時，三格化糞池基礎應與相鄰原建筑物基礎間保持一定凈距，其數值一般取不小于相鄰兩基礎底面的高差。
(二)開挖池坑時，對土質較好的地塊，宜采用直壁開挖，使磚塊緊貼坑壁砌筑;對土質差或有地下水的地塊，只好采用按一定坡度的放坡開挖，并留不小于150毫米的回填寬度。回填時，可在回填土內摻人30%的碎石或碎磚瓦，要對稱均勻，邊砌筑邊回填夯實，這樣可對池墻起到捅箍作用。
(三)對地下水位高的地段，在開挖池坑前，先得在池位附近挖掘一口2米深的集水井，用泵抽吸井內積水。只有這樣在不斷排泄地下水的條件下，才可進行池坑開挖和完成建池任務。
